Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SvoplQ6PDF3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms