Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rundc3bQ6PDC0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms