Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bhlhb9Q6PB60 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bhlhb9Q6PB60 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bhlhb9Q6PB60 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bhlhb9Q6PB60 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bhlhb9Q6PB60 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bhlhb9Q6PB60 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bhlhb9Q6PB60 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bhlhb9Q6PB60 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhb9Q6PB60 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhb9Q6PB60 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhb9Q6PB60 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhb9Q6PB60 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhb9Q6PB60 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhb9Q6PB60 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhb9Q6PB60 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhb9Q6PB60 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhb9Q6PB60 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhb9Q6PB60 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhb9Q6PB60 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhb9Q6PB60 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhb9Q6PB60 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhb9Q6PB60 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhb9Q6PB60 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhb9Q6PB60 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhb9Q6PB60 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms