Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAJ1

Bcr, Breakpoint cluster region protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcrQ6PAJ1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms