Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.2 ms