Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms