Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Soga3Q6NZL0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Soga3Q6NZL0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Soga3Q6NZL0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Soga3Q6NZL0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Soga3Q6NZL0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Soga3Q6NZL0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Soga3Q6NZL0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Soga3Q6NZL0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Soga3Q6NZL0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Soga3Q6NZL0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Soga3Q6NZL0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Soga3Q6NZL0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Soga3Q6NZL0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Soga3Q6NZL0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Soga3Q6NZL0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Soga3Q6NZL0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Soga3Q6NZL0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Soga3Q6NZL0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Soga3Q6NZL0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Soga3Q6NZL0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Soga3Q6NZL0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Soga3Q6NZL0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Soga3Q6NZL0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Soga3Q6NZL0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Soga3Q6NZL0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Soga3Q6NZL0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Soga3Q6NZL0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Soga3Q6NZL0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Soga3Q6NZL0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Soga3Q6NZL0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Soga3Q6NZL0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Soga3Q6NZL0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Soga3Q6NZL0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Soga3Q6NZL0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Soga3Q6NZL0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Soga3Q6NZL0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Soga3Q6NZL0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Soga3Q6NZL0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Soga3Q6NZL0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Soga3Q6NZL0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Soga3Q6NZL0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Soga3Q6NZL0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Soga3Q6NZL0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Soga3Q6NZL0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms