Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSU2

2810408A11Rik, RIKEN cDNA 2810408A11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2810408A11RikQ6NSU2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms