Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms