Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Scaf8Q6DID3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scaf8Q6DID3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Scaf8Q6DID3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scaf8Q6DID3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Scaf8Q6DID3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scaf8Q6DID3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scaf8Q6DID3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scaf8Q6DID3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scaf8Q6DID3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scaf8Q6DID3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scaf8Q6DID3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scaf8Q6DID3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scaf8Q6DID3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scaf8Q6DID3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scaf8Q6DID3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scaf8Q6DID3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scaf8Q6DID3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scaf8Q6DID3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scaf8Q6DID3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scaf8Q6DID3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scaf8Q6DID3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scaf8Q6DID3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scaf8Q6DID3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scaf8Q6DID3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scaf8Q6DID3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Scaf8Q6DID3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scaf8Q6DID3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scaf8Q6DID3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scaf8Q6DID3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scaf8Q6DID3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scaf8Q6DID3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scaf8Q6DID3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scaf8Q6DID3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scaf8Q6DID3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scaf8Q6DID3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scaf8Q6DID3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Scaf8Q6DID3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scaf8Q6DID3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scaf8Q6DID3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scaf8Q6DID3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scaf8Q6DID3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scaf8Q6DID3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scaf8Q6DID3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scaf8Q6DID3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scaf8Q6DID3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms