Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CltcQ68FD5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CltcQ68FD5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CltcQ68FD5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CltcQ68FD5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CltcQ68FD5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CltcQ68FD5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CltcQ68FD5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CltcQ68FD5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CltcQ68FD5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CltcQ68FD5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CltcQ68FD5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CltcQ68FD5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CltcQ68FD5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CltcQ68FD5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CltcQ68FD5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CltcQ68FD5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CltcQ68FD5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CltcQ68FD5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CltcQ68FD5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CltcQ68FD5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CltcQ68FD5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CltcQ68FD5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CltcQ68FD5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CltcQ68FD5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CltcQ68FD5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CltcQ68FD5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CltcQ68FD5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CltcQ68FD5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CltcQ68FD5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CltcQ68FD5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CltcQ68FD5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CltcQ68FD5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CltcQ68FD5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CltcQ68FD5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CltcQ68FD5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CltcQ68FD5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CltcQ68FD5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CltcQ68FD5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CltcQ68FD5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CltcQ68FD5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CltcQ68FD5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CltcQ68FD5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CltcQ68FD5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CltcQ68FD5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CltcQ68FD5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CltcQ68FD5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CltcQ68FD5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CltcQ68FD5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CltcQ68FD5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CltcQ68FD5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CltcQ68FD5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CltcQ68FD5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CltcQ68FD5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CltcQ68FD5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CltcQ68FD5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CltcQ68FD5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CltcQ68FD5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CltcQ68FD5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CltcQ68FD5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CltcQ68FD5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CltcQ68FD5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CltcQ68FD5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CltcQ68FD5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CltcQ68FD5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CltcQ68FD5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CltcQ68FD5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CltcQ68FD5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CltcQ68FD5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CltcQ68FD5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CltcQ68FD5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CltcQ68FD5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CltcQ68FD5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CltcQ68FD5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CltcQ68FD5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CltcQ68FD5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CltcQ68FD5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CltcQ68FD5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CltcQ68FD5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CltcQ68FD5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CltcQ68FD5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CltcQ68FD5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CltcQ68FD5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CltcQ68FD5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CltcQ68FD5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CltcQ68FD5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CltcQ68FD5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CltcQ68FD5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CltcQ68FD5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CltcQ68FD5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CltcQ68FD5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CltcQ68FD5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CltcQ68FD5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CltcQ68FD5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CltcQ68FD5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CltcQ68FD5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CltcQ68FD5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CltcQ68FD5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CltcQ68FD5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CltcQ68FD5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms