Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CilpQ66K08 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CilpQ66K08 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CilpQ66K08 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CilpQ66K08 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CilpQ66K08 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CilpQ66K08 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CilpQ66K08 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CilpQ66K08 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CilpQ66K08 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CilpQ66K08 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CilpQ66K08 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CilpQ66K08 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CilpQ66K08 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CilpQ66K08 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CilpQ66K08 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CilpQ66K08 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CilpQ66K08 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CilpQ66K08 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CilpQ66K08 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CilpQ66K08 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CilpQ66K08 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CilpQ66K08 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CilpQ66K08 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CilpQ66K08 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CilpQ66K08 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CilpQ66K08 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CilpQ66K08 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CilpQ66K08 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CilpQ66K08 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CilpQ66K08 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CilpQ66K08 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms