Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ccdc18Q640L5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ccdc18Q640L5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ccdc18Q640L5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ccdc18Q640L5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ccdc18Q640L5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Ccdc18Q640L5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Ccdc18Q640L5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ccdc18Q640L5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ccdc18Q640L5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ccdc18Q640L5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ccdc18Q640L5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ccdc18Q640L5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ccdc18Q640L5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ccdc18Q640L5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Ccdc18Q640L5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ccdc18Q640L5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ccdc18Q640L5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ccdc18Q640L5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ccdc18Q640L5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ccdc18Q640L5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ccdc18Q640L5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ccdc18Q640L5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ccdc18Q640L5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ccdc18Q640L5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ccdc18Q640L5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ccdc18Q640L5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ccdc18Q640L5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ccdc18Q640L5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ccdc18Q640L5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Ccdc18Q640L5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Ccdc18Q640L5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Ccdc18Q640L5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Ccdc18Q640L5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Ccdc18Q640L5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Ccdc18Q640L5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Ccdc18Q640L5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Ccdc18Q640L5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Ccdc18Q640L5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Ccdc18Q640L5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ccdc18Q640L5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ccdc18Q640L5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ccdc18Q640L5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ccdc18Q640L5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ccdc18Q640L5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ccdc18Q640L5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ccdc18Q640L5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Ccdc18Q640L5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ccdc18Q640L5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ccdc18Q640L5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Ccdc18Q640L5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Ccdc18Q640L5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Ccdc18Q640L5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Ccdc18Q640L5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Ccdc18Q640L5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Ccdc18Q640L5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Ccdc18Q640L5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ccdc18Q640L5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Ccdc18Q640L5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ccdc18Q640L5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ccdc18Q640L5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ccdc18Q640L5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ccdc18Q640L5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ccdc18Q640L5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ccdc18Q640L5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ccdc18Q640L5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ccdc18Q640L5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ccdc18Q640L5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ccdc18Q640L5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ccdc18Q640L5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ccdc18Q640L5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ccdc18Q640L5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ccdc18Q640L5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ccdc18Q640L5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ccdc18Q640L5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ccdc18Q640L5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ccdc18Q640L5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ccdc18Q640L5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ccdc18Q640L5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ccdc18Q640L5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ccdc18Q640L5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Ccdc18Q640L5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Ccdc18Q640L5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Ccdc18Q640L5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Ccdc18Q640L5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Ccdc18Q640L5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Ccdc18Q640L5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Ccdc18Q640L5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Ccdc18Q640L5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Ccdc18Q640L5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Ccdc18Q640L5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Ccdc18Q640L5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Ccdc18Q640L5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Ccdc18Q640L5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Ccdc18Q640L5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Ccdc18Q640L5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Ccdc18Q640L5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Ccdc18Q640L5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Ccdc18Q640L5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Ccdc18Q640L5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
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