Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vil1Q62468 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vil1Q62468 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vil1Q62468 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vil1Q62468 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vil1Q62468 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vil1Q62468 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vil1Q62468 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vil1Q62468 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vil1Q62468 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vil1Q62468 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vil1Q62468 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Vil1Q62468 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vil1Q62468 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vil1Q62468 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vil1Q62468 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vil1Q62468 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vil1Q62468 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vil1Q62468 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vil1Q62468 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Vil1Q62468 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Vil1Q62468 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vil1Q62468 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vil1Q62468 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vil1Q62468 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vil1Q62468 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vil1Q62468 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vil1Q62468 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vil1Q62468 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vil1Q62468 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vil1Q62468 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vil1Q62468 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vil1Q62468 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vil1Q62468 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vil1Q62468 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vil1Q62468 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vil1Q62468 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vil1Q62468 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vil1Q62468 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vil1Q62468 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vil1Q62468 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vil1Q62468 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vil1Q62468 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vil1Q62468 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vil1Q62468 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vil1Q62468 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vil1Q62468 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vil1Q62468 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vil1Q62468 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vil1Q62468 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vil1Q62468 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vil1Q62468 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vil1Q62468 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vil1Q62468 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms