Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TrhQ62361 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TrhQ62361 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TrhQ62361 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TrhQ62361 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TrhQ62361 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TrhQ62361 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TrhQ62361 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TrhQ62361 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TrhQ62361 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TrhQ62361 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TrhQ62361 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TrhQ62361 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TrhQ62361 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TrhQ62361 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TrhQ62361 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TrhQ62361 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TrhQ62361 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TrhQ62361 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TrhQ62361 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TrhQ62361 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TrhQ62361 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TrhQ62361 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TrhQ62361 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TrhQ62361 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TrhQ62361 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TrhQ62361 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TrhQ62361 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TrhQ62361 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TrhQ62361 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TrhQ62361 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TrhQ62361 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TrhQ62361 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TrhQ62361 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TrhQ62361 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TrhQ62361 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TrhQ62361 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TrhQ62361 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TrhQ62361 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TrhQ62361 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TrhQ62361 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TrhQ62361 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TrhQ62361 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TrhQ62361 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TrhQ62361 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TrhQ62361 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TrhQ62361 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms