Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms