Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Kdm5dQ62240 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Kdm5dQ62240 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Kdm5dQ62240 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Kdm5dQ62240 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Kdm5dQ62240 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Kdm5dQ62240 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Kdm5dQ62240 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Kdm5dQ62240 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Kdm5dQ62240 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Kdm5dQ62240 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Kdm5dQ62240 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Kdm5dQ62240 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Kdm5dQ62240 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Kdm5dQ62240 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Kdm5dQ62240 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
Kdm5dQ62240 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Kdm5dQ62240 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Kdm5dQ62240 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Kdm5dQ62240 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Kdm5dQ62240 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Kdm5dQ62240 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Kdm5dQ62240 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Kdm5dQ62240 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Kdm5dQ62240 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Kdm5dQ62240 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Kdm5dQ62240 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
Kdm5dQ62240 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
Kdm5dQ62240 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Kdm5dQ62240 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Kdm5dQ62240 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Kdm5dQ62240 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Kdm5dQ62240 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Kdm5dQ62240 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Kdm5dQ62240 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Kdm5dQ62240 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Kdm5dQ62240 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Kdm5dQ62240 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Kdm5dQ62240 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Kdm5dQ62240 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Kdm5dQ62240 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
Kdm5dQ62240 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Kdm5dQ62240 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Kdm5dQ62240 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
Kdm5dQ62240 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Kdm5dQ62240 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Kdm5dQ62240 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Kdm5dQ62240 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Kdm5dQ62240 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Kdm5dQ62240 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
Kdm5dQ62240 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Kdm5dQ62240 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
Kdm5dQ62240 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Kdm5dQ62240 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Kdm5dQ62240 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Kdm5dQ62240 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Kdm5dQ62240 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Kdm5dQ62240 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Kdm5dQ62240 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Kdm5dQ62240 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Kdm5dQ62240 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Kdm5dQ62240 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Kdm5dQ62240 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
Kdm5dQ62240 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Kdm5dQ62240 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Kdm5dQ62240 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Kdm5dQ62240 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Kdm5dQ62240 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Kdm5dQ62240 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Kdm5dQ62240 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Kdm5dQ62240 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Kdm5dQ62240 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Kdm5dQ62240 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Kdm5dQ62240 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
Kdm5dQ62240 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Kdm5dQ62240 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Kdm5dQ62240 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
Kdm5dQ62240 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Kdm5dQ62240 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Kdm5dQ62240 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.57
Kdm5dQ62240 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.57
Kdm5dQ62240 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.57
Kdm5dQ62240 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.57
Kdm5dQ62240 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC37.32■■■■□ 3.57
Kdm5dQ62240 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.57
Kdm5dQ62240 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Kdm5dQ62240 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Kdm5dQ62240 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Kdm5dQ62240 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Kdm5dQ62240 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Kdm5dQ62240 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Kdm5dQ62240 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Kdm5dQ62240 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Kdm5dQ62240 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Kdm5dQ62240 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Kdm5dQ62240 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Kdm5dQ62240 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
Kdm5dQ62240 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Kdm5dQ62240 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Kdm5dQ62240 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms