Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms