Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Npm1Q61937 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Npm1Q61937 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Npm1Q61937 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Npm1Q61937 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Npm1Q61937 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Npm1Q61937 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Npm1Q61937 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Npm1Q61937 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Npm1Q61937 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.81
Npm1Q61937 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Npm1Q61937 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Npm1Q61937 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Npm1Q61937 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Npm1Q61937 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Npm1Q61937 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Npm1Q61937 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Npm1Q61937 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Npm1Q61937 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Npm1Q61937 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Npm1Q61937 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Npm1Q61937 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Npm1Q61937 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Npm1Q61937 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Npm1Q61937 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Npm1Q61937 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Npm1Q61937 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Npm1Q61937 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Npm1Q61937 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Npm1Q61937 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Npm1Q61937 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Npm1Q61937 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Npm1Q61937 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Npm1Q61937 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Npm1Q61937 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Npm1Q61937 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Npm1Q61937 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Npm1Q61937 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Npm1Q61937 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Npm1Q61937 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Npm1Q61937 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Npm1Q61937 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Npm1Q61937 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Npm1Q61937 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Npm1Q61937 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Npm1Q61937 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Npm1Q61937 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Npm1Q61937 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Npm1Q61937 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Npm1Q61937 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Npm1Q61937 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Npm1Q61937 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Npm1Q61937 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Npm1Q61937 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Npm1Q61937 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Npm1Q61937 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Npm1Q61937 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Npm1Q61937 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Npm1Q61937 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Npm1Q61937 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Npm1Q61937 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Npm1Q61937 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Npm1Q61937 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Npm1Q61937 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Npm1Q61937 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Npm1Q61937 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Npm1Q61937 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Npm1Q61937 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Npm1Q61937 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Npm1Q61937 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Npm1Q61937 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
Npm1Q61937 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Npm1Q61937 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Npm1Q61937 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Npm1Q61937 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Npm1Q61937 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Npm1Q61937 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Npm1Q61937 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Npm1Q61937 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Npm1Q61937 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Npm1Q61937 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Npm1Q61937 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Npm1Q61937 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Npm1Q61937 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Npm1Q61937 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Npm1Q61937 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Npm1Q61937 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Npm1Q61937 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Npm1Q61937 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Npm1Q61937 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Npm1Q61937 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Npm1Q61937 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Npm1Q61937 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Npm1Q61937 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Npm1Q61937 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Npm1Q61937 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Npm1Q61937 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Npm1Q61937 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Npm1Q61937 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Npm1Q61937 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms