Protein–RNA interactions for Protein: Q61897

Krt33b, Keratin, type I cuticular Ha3-II, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33bQ61897 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms