Protein–RNA interactions for Protein: Q61716

Ifna11, Interferon alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna11Q61716 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna11Q61716 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna11Q61716 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna11Q61716 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna11Q61716 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna11Q61716 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna11Q61716 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna11Q61716 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna11Q61716 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna11Q61716 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna11Q61716 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna11Q61716 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna11Q61716 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna11Q61716 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna11Q61716 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna11Q61716 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna11Q61716 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna11Q61716 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna11Q61716 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna11Q61716 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna11Q61716 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna11Q61716 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna11Q61716 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna11Q61716 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna11Q61716 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna11Q61716 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna11Q61716 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna11Q61716 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna11Q61716 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna11Q61716 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna11Q61716 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna11Q61716 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna11Q61716 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna11Q61716 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna11Q61716 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna11Q61716 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna11Q61716 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna11Q61716 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna11Q61716 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna11Q61716 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna11Q61716 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna11Q61716 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms