Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd53Q61451 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd53Q61451 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd53Q61451 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd53Q61451 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd53Q61451 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd53Q61451 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd53Q61451 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd53Q61451 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd53Q61451 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd53Q61451 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd53Q61451 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd53Q61451 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd53Q61451 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd53Q61451 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd53Q61451 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd53Q61451 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd53Q61451 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd53Q61451 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd53Q61451 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd53Q61451 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd53Q61451 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd53Q61451 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd53Q61451 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd53Q61451 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd53Q61451 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd53Q61451 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd53Q61451 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd53Q61451 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd53Q61451 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms