Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BcanQ61361 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BcanQ61361 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BcanQ61361 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BcanQ61361 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BcanQ61361 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BcanQ61361 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BcanQ61361 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BcanQ61361 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BcanQ61361 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BcanQ61361 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BcanQ61361 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BcanQ61361 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BcanQ61361 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BcanQ61361 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BcanQ61361 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BcanQ61361 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BcanQ61361 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BcanQ61361 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BcanQ61361 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BcanQ61361 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BcanQ61361 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BcanQ61361 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BcanQ61361 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BcanQ61361 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BcanQ61361 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BcanQ61361 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BcanQ61361 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BcanQ61361 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BcanQ61361 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BcanQ61361 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BcanQ61361 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BcanQ61361 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BcanQ61361 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BcanQ61361 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BcanQ61361 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BcanQ61361 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BcanQ61361 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BcanQ61361 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BcanQ61361 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BcanQ61361 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BcanQ61361 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BcanQ61361 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BcanQ61361 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BcanQ61361 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BcanQ61361 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BcanQ61361 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BcanQ61361 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BcanQ61361 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BcanQ61361 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BcanQ61361 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BcanQ61361 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BcanQ61361 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BcanQ61361 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BcanQ61361 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BcanQ61361 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BcanQ61361 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BcanQ61361 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BcanQ61361 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BcanQ61361 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BcanQ61361 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BcanQ61361 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BcanQ61361 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BcanQ61361 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BcanQ61361 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BcanQ61361 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BcanQ61361 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BcanQ61361 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BcanQ61361 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BcanQ61361 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BcanQ61361 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BcanQ61361 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BcanQ61361 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BcanQ61361 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BcanQ61361 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BcanQ61361 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BcanQ61361 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BcanQ61361 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BcanQ61361 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BcanQ61361 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BcanQ61361 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BcanQ61361 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BcanQ61361 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BcanQ61361 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BcanQ61361 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BcanQ61361 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BcanQ61361 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BcanQ61361 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BcanQ61361 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BcanQ61361 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BcanQ61361 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BcanQ61361 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BcanQ61361 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BcanQ61361 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BcanQ61361 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BcanQ61361 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BcanQ61361 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BcanQ61361 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BcanQ61361 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BcanQ61361 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms