Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rbbp4Q60972 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms