Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnot7Q60809 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cnot7Q60809 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cnot7Q60809 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnot7Q60809 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnot7Q60809 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnot7Q60809 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnot7Q60809 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnot7Q60809 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnot7Q60809 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnot7Q60809 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnot7Q60809 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnot7Q60809 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnot7Q60809 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnot7Q60809 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnot7Q60809 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnot7Q60809 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnot7Q60809 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnot7Q60809 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnot7Q60809 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnot7Q60809 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnot7Q60809 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnot7Q60809 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnot7Q60809 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnot7Q60809 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnot7Q60809 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms