Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms