Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Atf3Q60765 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atf3Q60765 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atf3Q60765 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atf3Q60765 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Atf3Q60765 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atf3Q60765 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atf3Q60765 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atf3Q60765 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atf3Q60765 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atf3Q60765 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atf3Q60765 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atf3Q60765 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atf3Q60765 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atf3Q60765 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atf3Q60765 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atf3Q60765 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atf3Q60765 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atf3Q60765 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atf3Q60765 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atf3Q60765 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atf3Q60765 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Atf3Q60765 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atf3Q60765 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atf3Q60765 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atf3Q60765 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atf3Q60765 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atf3Q60765 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atf3Q60765 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Atf3Q60765 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atf3Q60765 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atf3Q60765 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atf3Q60765 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atf3Q60765 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atf3Q60765 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atf3Q60765 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Atf3Q60765 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Atf3Q60765 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Atf3Q60765 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Atf3Q60765 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Atf3Q60765 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Atf3Q60765 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Atf3Q60765 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atf3Q60765 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atf3Q60765 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atf3Q60765 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atf3Q60765 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atf3Q60765 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Atf3Q60765 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Atf3Q60765 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atf3Q60765 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atf3Q60765 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atf3Q60765 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atf3Q60765 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atf3Q60765 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atf3Q60765 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atf3Q60765 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atf3Q60765 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atf3Q60765 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atf3Q60765 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atf3Q60765 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atf3Q60765 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atf3Q60765 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atf3Q60765 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atf3Q60765 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atf3Q60765 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atf3Q60765 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atf3Q60765 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atf3Q60765 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atf3Q60765 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atf3Q60765 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atf3Q60765 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atf3Q60765 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atf3Q60765 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atf3Q60765 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atf3Q60765 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atf3Q60765 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atf3Q60765 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atf3Q60765 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Atf3Q60765 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atf3Q60765 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atf3Q60765 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atf3Q60765 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atf3Q60765 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Atf3Q60765 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Atf3Q60765 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atf3Q60765 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atf3Q60765 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atf3Q60765 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atf3Q60765 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atf3Q60765 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Atf3Q60765 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atf3Q60765 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atf3Q60765 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atf3Q60765 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atf3Q60765 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atf3Q60765 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atf3Q60765 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atf3Q60765 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Atf3Q60765 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms