Protein–RNA interactions for Protein: Q60696

Pmel, Melanocyte protein PMEL, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmelQ60696 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PmelQ60696 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PmelQ60696 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PmelQ60696 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PmelQ60696 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PmelQ60696 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PmelQ60696 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PmelQ60696 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PmelQ60696 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PmelQ60696 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PmelQ60696 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms