Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms