Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sik1Q60670 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sik1Q60670 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sik1Q60670 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sik1Q60670 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Sik1Q60670 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Sik1Q60670 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sik1Q60670 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sik1Q60670 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sik1Q60670 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sik1Q60670 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sik1Q60670 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sik1Q60670 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sik1Q60670 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sik1Q60670 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sik1Q60670 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sik1Q60670 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sik1Q60670 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sik1Q60670 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sik1Q60670 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sik1Q60670 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sik1Q60670 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sik1Q60670 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sik1Q60670 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sik1Q60670 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sik1Q60670 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sik1Q60670 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sik1Q60670 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sik1Q60670 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sik1Q60670 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sik1Q60670 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sik1Q60670 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sik1Q60670 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sik1Q60670 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sik1Q60670 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Sik1Q60670 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Sik1Q60670 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sik1Q60670 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Sik1Q60670 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sik1Q60670 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sik1Q60670 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sik1Q60670 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sik1Q60670 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sik1Q60670 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sik1Q60670 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sik1Q60670 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sik1Q60670 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sik1Q60670 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sik1Q60670 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sik1Q60670 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sik1Q60670 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sik1Q60670 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sik1Q60670 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sik1Q60670 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sik1Q60670 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sik1Q60670 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sik1Q60670 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sik1Q60670 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sik1Q60670 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sik1Q60670 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Sik1Q60670 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Sik1Q60670 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sik1Q60670 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sik1Q60670 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sik1Q60670 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sik1Q60670 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sik1Q60670 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sik1Q60670 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sik1Q60670 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sik1Q60670 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sik1Q60670 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sik1Q60670 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Sik1Q60670 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sik1Q60670 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sik1Q60670 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sik1Q60670 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sik1Q60670 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sik1Q60670 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sik1Q60670 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sik1Q60670 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sik1Q60670 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sik1Q60670 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sik1Q60670 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sik1Q60670 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sik1Q60670 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sik1Q60670 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Sik1Q60670 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sik1Q60670 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sik1Q60670 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sik1Q60670 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sik1Q60670 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sik1Q60670 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sik1Q60670 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sik1Q60670 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sik1Q60670 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sik1Q60670 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sik1Q60670 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sik1Q60670 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sik1Q60670 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Sik1Q60670 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms