Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf123Q5XPI3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms