Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Med13Q5SWW4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms