Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW46

Lpo, Lactoperoxidase, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LpoQ5SW46 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LpoQ5SW46 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LpoQ5SW46 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LpoQ5SW46 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LpoQ5SW46 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LpoQ5SW46 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LpoQ5SW46 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LpoQ5SW46 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LpoQ5SW46 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LpoQ5SW46 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LpoQ5SW46 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LpoQ5SW46 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LpoQ5SW46 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LpoQ5SW46 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LpoQ5SW46 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LpoQ5SW46 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LpoQ5SW46 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LpoQ5SW46 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LpoQ5SW46 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LpoQ5SW46 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LpoQ5SW46 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LpoQ5SW46 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LpoQ5SW46 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LpoQ5SW46 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LpoQ5SW46 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LpoQ5SW46 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LpoQ5SW46 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LpoQ5SW46 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LpoQ5SW46 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LpoQ5SW46 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LpoQ5SW46 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LpoQ5SW46 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LpoQ5SW46 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LpoQ5SW46 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LpoQ5SW46 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LpoQ5SW46 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LpoQ5SW46 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms