Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW45

Mks1, Meckel syndrome type 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mks1Q5SW45 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms