Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Bhlha9Q5RJB0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms