Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trdv4Q5R1A3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms