Protein–RNA interactions for Protein: Q5M8N4

Sdr39u1, Epimerase family protein SDR39U1, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr39u1Q5M8N4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr39u1Q5M8N4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdr39u1Q5M8N4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdr39u1Q5M8N4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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