Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL78

Khdc1c, KH homology domain-containing protein 1C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1cQ4KL78 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc1cQ4KL78 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc1cQ4KL78 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc1cQ4KL78 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc1cQ4KL78 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc1cQ4KL78 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc1cQ4KL78 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc1cQ4KL78 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc1cQ4KL78 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc1cQ4KL78 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc1cQ4KL78 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Khdc1cQ4KL78 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Khdc1cQ4KL78 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Khdc1cQ4KL78 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Khdc1cQ4KL78 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Khdc1cQ4KL78 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Khdc1cQ4KL78 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Khdc1cQ4KL78 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Khdc1cQ4KL78 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Khdc1cQ4KL78 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Khdc1cQ4KL78 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Khdc1cQ4KL78 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Khdc1cQ4KL78 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Khdc1cQ4KL78 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Khdc1cQ4KL78 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Khdc1cQ4KL78 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Khdc1cQ4KL78 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Khdc1cQ4KL78 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Khdc1cQ4KL78 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Khdc1cQ4KL78 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Khdc1cQ4KL78 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Khdc1cQ4KL78 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Khdc1cQ4KL78 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Khdc1cQ4KL78 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Khdc1cQ4KL78 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Khdc1cQ4KL78 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Khdc1cQ4KL78 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Khdc1cQ4KL78 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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