Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa20Q45VN2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms