Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrc43Q3V0L5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrc43Q3V0L5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrc43Q3V0L5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrc43Q3V0L5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrc43Q3V0L5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrc43Q3V0L5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrc43Q3V0L5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrc43Q3V0L5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrc43Q3V0L5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrc43Q3V0L5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrc43Q3V0L5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrc43Q3V0L5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrc43Q3V0L5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrc43Q3V0L5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrc43Q3V0L5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrc43Q3V0L5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrc43Q3V0L5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrc43Q3V0L5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrc43Q3V0L5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrc43Q3V0L5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrc43Q3V0L5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrc43Q3V0L5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrc43Q3V0L5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrc43Q3V0L5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrc43Q3V0L5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrc43Q3V0L5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrc43Q3V0L5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrc43Q3V0L5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrc43Q3V0L5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrc43Q3V0L5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrc43Q3V0L5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrc43Q3V0L5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrc43Q3V0L5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrc43Q3V0L5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrc43Q3V0L5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrc43Q3V0L5 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrc43Q3V0L5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrc43Q3V0L5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrc43Q3V0L5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrc43Q3V0L5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrc43Q3V0L5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrc43Q3V0L5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrc43Q3V0L5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrc43Q3V0L5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrc43Q3V0L5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrc43Q3V0L5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrc43Q3V0L5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrc43Q3V0L5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lrrc43Q3V0L5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lrrc43Q3V0L5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lrrc43Q3V0L5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
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