Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc160Q3UYG1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms