Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hdgfl2Q3UMU9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hdgfl2Q3UMU9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hdgfl2Q3UMU9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hdgfl2Q3UMU9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hdgfl2Q3UMU9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hdgfl2Q3UMU9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hdgfl2Q3UMU9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hdgfl2Q3UMU9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hdgfl2Q3UMU9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hdgfl2Q3UMU9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hdgfl2Q3UMU9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hdgfl2Q3UMU9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hdgfl2Q3UMU9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hdgfl2Q3UMU9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hdgfl2Q3UMU9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hdgfl2Q3UMU9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hdgfl2Q3UMU9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hdgfl2Q3UMU9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hdgfl2Q3UMU9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hdgfl2Q3UMU9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hdgfl2Q3UMU9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdgfl2Q3UMU9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdgfl2Q3UMU9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdgfl2Q3UMU9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdgfl2Q3UMU9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdgfl2Q3UMU9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hdgfl2Q3UMU9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms