Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms