Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBX0

Tmem109, Transmembrane protein 109, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem109Q3UBX0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem109Q3UBX0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem109Q3UBX0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem109Q3UBX0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem109Q3UBX0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem109Q3UBX0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem109Q3UBX0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem109Q3UBX0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem109Q3UBX0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem109Q3UBX0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem109Q3UBX0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem109Q3UBX0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem109Q3UBX0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem109Q3UBX0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem109Q3UBX0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem109Q3UBX0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem109Q3UBX0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem109Q3UBX0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem109Q3UBX0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms