Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Rnf180Q3U827 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf180Q3U827 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rnf180Q3U827 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rnf180Q3U827 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rnf180Q3U827 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf180Q3U827 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf180Q3U827 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf180Q3U827 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf180Q3U827 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf180Q3U827 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf180Q3U827 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf180Q3U827 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf180Q3U827 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf180Q3U827 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf180Q3U827 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf180Q3U827 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf180Q3U827 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf180Q3U827 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf180Q3U827 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf180Q3U827 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf180Q3U827 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf180Q3U827 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf180Q3U827 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf180Q3U827 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf180Q3U827 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf180Q3U827 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf180Q3U827 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf180Q3U827 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf180Q3U827 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf180Q3U827 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf180Q3U827 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf180Q3U827 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf180Q3U827 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf180Q3U827 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf180Q3U827 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf180Q3U827 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf180Q3U827 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf180Q3U827 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf180Q3U827 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf180Q3U827 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf180Q3U827 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf180Q3U827 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf180Q3U827 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf180Q3U827 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
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