Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf149Q3U2C5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf149Q3U2C5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf149Q3U2C5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf149Q3U2C5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf149Q3U2C5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf149Q3U2C5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf149Q3U2C5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf149Q3U2C5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf149Q3U2C5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf149Q3U2C5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf149Q3U2C5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf149Q3U2C5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf149Q3U2C5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf149Q3U2C5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf149Q3U2C5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf149Q3U2C5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf149Q3U2C5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf149Q3U2C5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf149Q3U2C5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf149Q3U2C5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf149Q3U2C5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf149Q3U2C5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf149Q3U2C5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf149Q3U2C5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf149Q3U2C5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf149Q3U2C5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf149Q3U2C5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf149Q3U2C5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf149Q3U2C5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms