Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf3c3Q3TMP1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms