Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms