Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNP5

V1rd19, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1rd19Q3KNP5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
V1rd19Q3KNP5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
V1rd19Q3KNP5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
V1rd19Q3KNP5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
V1rd19Q3KNP5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
V1rd19Q3KNP5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
V1rd19Q3KNP5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
V1rd19Q3KNP5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms