Protein–RNA interactions for Protein: Q2MDG0

Rhox4d, Reproductive homeobox 4D, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox4dQ2MDG0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhox4dQ2MDG0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhox4dQ2MDG0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhox4dQ2MDG0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox4dQ2MDG0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox4dQ2MDG0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox4dQ2MDG0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox4dQ2MDG0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox4dQ2MDG0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox4dQ2MDG0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox4dQ2MDG0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox4dQ2MDG0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox4dQ2MDG0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox4dQ2MDG0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox4dQ2MDG0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox4dQ2MDG0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox4dQ2MDG0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox4dQ2MDG0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox4dQ2MDG0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox4dQ2MDG0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox4dQ2MDG0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox4dQ2MDG0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox4dQ2MDG0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox4dQ2MDG0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox4dQ2MDG0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox4dQ2MDG0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox4dQ2MDG0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox4dQ2MDG0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox4dQ2MDG0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox4dQ2MDG0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox4dQ2MDG0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox4dQ2MDG0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox4dQ2MDG0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox4dQ2MDG0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox4dQ2MDG0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox4dQ2MDG0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox4dQ2MDG0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox4dQ2MDG0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox4dQ2MDG0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox4dQ2MDG0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox4dQ2MDG0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox4dQ2MDG0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rhox4dQ2MDG0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox4dQ2MDG0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox4dQ2MDG0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox4dQ2MDG0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox4dQ2MDG0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox4dQ2MDG0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox4dQ2MDG0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rhox4dQ2MDG0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rhox4dQ2MDG0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rhox4dQ2MDG0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rhox4dQ2MDG0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Rhox4dQ2MDG0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms